I GeoRef arbetar man via en guide som är uppdelad i antal steg:
Steg 1: man anger sökvägen till den rasterbild som ska bearbetas.
Steg 2: man anger vilken typ av georeferens som ska utföras.
Steg 3: man anger de uppgifter som behövs för aktuell georeferens.
Steg 4: man analyserar kvalitén på den kommande georeferensen.
Steg 5: man genomför själva georeferensen och sparar den georefererade bilden.